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@chainsawriot

chainsawriot/analysis.R

Last active August 29, 2015 14:22
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rainstorm
Raw
analysis.R
require(dplyr)
require(magrittr)
# 95% CI: assume normally distributed
read.table("rainstorm.fwf") %>% mutate(hr = V6 + (V7/60)) %>% group_by(V1) %>% summarise(meanhr = mean(hr), sehr = sqrt(var(hr)/(length(hr)-1)), lowerCI = meanhr - (1.96*sehr), upperCI = meanhr + (1.96*sehr))
# Median and 2.5 and 97.5 percentile. Mean > Median, the data is positive skew and mean will overestimate the central tendency. Use median for robustness
read.table("rainstorm.fwf") %>% mutate(hr = V6 + (V7/60)) %>% group_by(V1) %>% summarise(medianhr = median(hr), lowerqhr = quantile(hr, probs = 0.025), upperqhr = quantile(hr, probs = 0.975))
calBootMedianCI <- function(x, rep = 10000, probs) {
quantile(replicate(rep, median(sample(x, length(x), replace = TRUE))), probs = probs)
}
read.table("rainstorm.fwf") %>% mutate(hr = V6 + (V7/60)) %>% group_by(V1) %>% summarise(medianhr = median(hr), medianlower = calBootMedianCI(hr, rep = 1000, probs = 0.025),medianupper = calBootMedianCI(hr, rep = 1000, probs = 0.975))
Raw
rainstorm
R version 3.2.0 (2015-04-16) -- "Full of Ingredients"
Copyright (C) 2015 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
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Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
> options(STERM='iESS', str.dendrogram.last="'", editor='emacsclient', show.error.locations=TRUE)
> require(dplyr)
Loading required package: dplyr
Attaching package: ‘dplyr’
The following object is masked from ‘package:stats’:
filter
The following objects are masked from ‘package:base’:
intersect, setdiff, setequal, union
> require(magrittr)
Loading required package: magrittr
>
> # 95% CI: assume normally distributed
>
> read.table("rainstorm.fwf") %>% mutate(hr = V6 + (V7/60)) %>% group_by(V1) %>% summarise(meanhr = mean(hr), sehr = sqrt(var(hr)/(length(hr)-1)), lowerCI = meanhr - (1.96*sehr), upperCI = meanhr + (1.96*sehr))
Source: local data frame [3 x 5]
V1 meanhr sehr lowerCI upperCI
1 紅色 2.447650 0.2679073 1.922551 2.972748
2 黃色 2.722000 0.1267450 2.473580 2.970420
3 黑色 2.918421 0.3738652 2.185645 3.651197
>
> # Median and 2.5 and 97.5 percentile. Mean > Median, the data is positive skew and mean will overestimate the central tendency. Use median for robustness
>
> read.table("rainstorm.fwf") %>% mutate(hr = V6 + (V7/60)) %>% group_by(V1) %>% summarise(medianhr = median(hr), lowerqhr = quantile(hr, probs = 0.025), upperqhr = quantile(hr, probs = 0.975))
Source: local data frame [3 x 4]
V1 medianhr lowerqhr upperqhr
1 紅色 1.708333 0.3270833 9.547917
2 黃色 1.916667 0.4458333 8.750000
3 黑色 2.333333 0.8541667 5.693333
>
> calBootMedianCI <- function(x, rep = 10000, probs) {
+ quantile(replicate(rep, median(sample(x, length(x), replace = TRUE))), probs = probs)
+ }
>
> read.table("rainstorm.fwf") %>% mutate(hr = V6 + (V7/60)) %>% group_by(V1) %>% summarise(medianhr = median(hr), medianlower = calBootMedianCI(hr, rep = 1000, probs = 0.025),medianupper = calBootMedianCI(hr, rep = 1000, probs = 0.975))
Source: local data frame [3 x 4]
V1 medianhr medianlower medianupper
1 紅色 1.708333 1.333333 2.125000
2 黃色 1.916667 1.833333 2.166667
3 黑色 2.333333 2.000000 4.083333
>
Raw
rainstorm.fwf
黃色 1998/04/12 05:15 1998/04/12 08:00 02 45
黃色 1998/04/26 21:15 1998/04/26 21:50 00 35
紅色 1998/04/26 21:50 1998/04/27 04:00 06 10
黃色 1998/04/27 04:00 1998/04/27 05:45 01 45
黃色 1998/05/02 16:20 1998/05/02 17:50 01 30
紅色 1998/05/02 17:50 1998/05/02 20:00 02 10
黃色 1998/05/15 08:40 1998/05/15 13:10 04 30
黃色 1998/05/24 08:15 1998/05/24 12:45 04 30
紅色 1998/05/24 12:45 1998/05/24 15:45 03 00
黃色 1998/06/04 05:00 1998/06/04 08:15 03 15
黃色 1998/06/04 19:00 1998/06/04 22:15 03 15
黃色 1998/06/09 02:45 1998/06/09 04:40 01 55
紅色 1998/06/09 04:40 1998/06/09 06:35 01 55
黑色 1998/06/09 06:35 1998/06/09 09:50 03 15
紅色 1998/06/09 09:50 1998/06/09 21:00 11 10
黃色 1998/06/10 04:00 1998/06/10 11:30 07 30
黃色 1998/06/11 05:25 1998/06/11 08:20 02 55
黃色 1998/06/23 14:50 1998/06/23 19:50 05 00
黃色 1998/07/02 16:00 1998/07/02 18:20 02 20
黃色 1998/07/03 10:00 1998/07/03 15:00 05 00
黃色 1998/07/04 08:00 1998/07/04 11:15 03 15
黃色 1998/07/04 17:40 1998/07/04 20:45 03 05
黃色 1998/07/13 04:25 1998/07/13 06:45 02 20
黃色 1998/08/07 05:40 1998/08/07 08:30 02 50
黃色 1998/08/28 15:10 1998/08/28 17:20 02 10
黃色 1998/08/30 22:20 1998/08/31 06:45 08 25
黃色 1998/09/01 11:45 1998/09/01 13:30 01 45
黃色 1998/09/06 15:45 1998/09/06 17:45 02 00
黃色 1999/04/12 01:15 1999/04/12 08:00 06 45
黃色 1999/05/19 04:40 1999/05/19 13:45 09 05
黃色 1999/06/07 03:20 1999/06/07 10:35 07 15
黃色 1999/06/17 08:40 1999/06/17 10:30 01 50
黃色 1999/06/20 11:20 1999/06/20 13:50 02 30
黃色 1999/06/21 09:00 1999/06/21 10:40 01 40
黃色 1999/07/08 10:30 1999/07/08 11:45 01 15
黃色 1999/07/09 11:20 1999/07/09 13:45 02 25
黃色 1999/08/04 07:35 1999/08/04 09:40 02 05
黃色 1999/08/05 18:25 1999/08/05 21:30 03 05
黃色 1999/08/10 05:00 1999/08/10 07:00 02 00
黃色 1999/08/11 17:35 1999/08/11 19:25 01 50
黃色 1999/08/22 13:55 1999/08/23 05:25 15 30
紅色 1999/08/23 05:25 1999/08/23 06:13 00 48
黑色 1999/08/23 06:13 1999/08/23 12:00 05 47
黃色 1999/08/23 12:00 1999/08/23 19:00 07 00
黃色 1999/08/24 02:05 1999/08/24 03:00 00 55
紅色 1999/08/24 03:00 1999/08/24 04:35 01 35
黑色 1999/08/24 04:35 1999/08/24 10:00 05 25
紅色 1999/08/24 10:00 1999/08/24 12:00 02 00
黃色 1999/08/25 03:30 1999/08/25 04:05 00 35
紅色 1999/08/25 04:05 1999/08/25 05:45 01 40
黃色 1999/08/25 05:45 1999/08/25 16:00 10 15
黃色 1999/09/16 04:50 1999/09/16 05:27 00 37
紅色 1999/09/16 05:27 1999/09/16 18:40 13 13
黃色 1999/09/26 09:55 1999/09/26 13:20 03 25
黃色 1999/10/16 06:30 1999/10/16 08:35 02 05
黃色 2000/04/02 22:15 2000/04/02 24:00 01 45
紅色 2000/04/03 00:00 2000/04/03 05:50 05 50
黃色 2000/04/03 05:50 2000/04/03 07:30 01 40
黃色 2000/04/03 20:05 2000/04/03 22:30 02 25
黃色 2000/04/14 03:00 2000/04/14 05:35 02 35
紅色 2000/04/14 05:35 2000/04/14 10:55 05 20
黃色 2000/04/14 10:55 2000/04/14 14:05 03 10
紅色 2000/04/14 14:05 2000/04/14 16:20 02 15
黃色 2000/04/22 23:40 2000/04/23 01:10 01 30
紅色 2000/04/23 01:10 2000/04/23 01:50 00 40
黑色 2000/04/23 01:50 2000/04/23 05:55 04 05
黃色 2000/04/23 05:55 2000/04/23 10:15 04 20
黃色 2000/04/26 16:55 2000/04/26 20:30 03 35
黃色 2000/04/28 15:25 2000/04/28 21:00 05 35
黃色 2000/05/02 05:40 2000/05/02 11:30 05 50
黃色 2000/05/02 20:15 2000/05/02 22:00 01 45
黃色 2000/05/10 12:38 2000/05/10 15:30 02 52
黃色 2000/05/25 01:10 2000/05/25 03:50 02 40
黃色 2000/06/12 03:00 2000/06/12 05:30 02 30
紅色 2000/06/12 05:30 2000/06/12 06:20 00 50
黑色 2000/06/12 06:20 2000/06/12 08:50 02 30
黃色 2000/06/12 08:50 2000/06/12 09:35 00 45
黃色 2000/06/18 06:20 2000/06/18 11:10 04 50
黃色 2000/06/20 06:40 2000/06/20 09:15 02 35
黃色 2000/07/18 05:05 2000/07/18 13:50 08 45
黃色 2000/07/19 12:55 2000/07/19 14:00 01 05
黃色 2000/08/01 10:40 2000/08/01 12:00 01 20
黃色 2000/08/02 05:45 2000/08/02 10:05 04 20
黃色 2000/08/03 05:40 2000/08/03 08:30 02 50
黃色 2000/08/03 11:15 2000/08/03 13:30 02 15
黃色 2000/08/04 07:35 2000/08/04 11:15 03 40
黃色 2000/08/04 14:40 2000/08/04 16:00 01 20
黃色 2000/08/06 08:35 2000/08/06 10:50 02 15
黃色 2000/08/24 00:25 2000/08/24 01:36 01 11
紅色 2000/08/24 01:36 2000/08/24 03:05 01 29
黑色 2000/08/24 03:05 2000/08/24 05:55 02 50
黃色 2000/08/24 13:50 2000/08/24 18:30 04 40
黃色 2000/08/26 11:20 2000/08/26 14:00 02 40
黃色 2000/08/27 14:00 2000/08/27 17:45 03 45
黃色 2000/09/02 08:25 2000/09/02 13:45 05 20
黃色 2001/03/25 13:25 2001/03/25 15:15 01 50
黃色 2001/04/09 17:35 2001/04/09 19:05 01 30
黃色 2001/05/09 15:35 2001/05/09 17:30 01 55
黃色 2001/05/18 09:20 2001/05/18 14:45 05 25
黃色 2001/05/21 17:35 2001/05/21 21:00 03 25
黃色 2001/05/30 16:05 2001/05/30 19:30 03 25
黃色 2001/06/05 18:05 2001/06/06 11:30 17 25
黃色 2001/06/07 05:00 2001/06/07 22:05 17 05
黃色 2001/06/08 04:25 2001/06/08 08:20 03 55
紅色 2001/06/08 08:20 2001/06/08 14:15 05 55
黃色 2001/06/08 14:15 2001/06/08 16:30 02 15
黃色 2001/06/09 04:15 2001/06/09 09:30 05 15
紅色 2001/06/09 09:30 2001/06/09 13:30 04 00
黃色 2001/06/09 13:30 2001/06/09 15:30 02 00
黃色 2001/06/10 08:20 2001/06/10 13:30 05 10
黃色 2001/06/11 07:20 2001/06/11 10:35 03 15
紅色 2001/06/11 10:35 2001/06/11 13:30 02 55
黃色 2001/06/11 13:30 2001/06/11 15:15 01 45
黃色 2001/06/12 02:35 2001/06/12 04:35 02 00
紅色 2001/06/12 04:35 2001/06/12 06:15 01 40
黃色 2001/06/12 06:15 2001/06/12 15:00 08 45
黃色 2001/06/13 05:35 2001/06/13 10:30 04 55
黃色 2001/06/23 20:35 2001/06/24 06:30 09 55
黃色 2001/06/25 18:05 2001/06/25 23:00 04 55
黃色 2001/06/26 15:00 2001/06/26 18:15 03 15
黃色 2001/06/27 08:45 2001/06/27 14:35 05 50
紅色 2001/06/27 14:35 2001/06/27 19:55 05 20
黃色 2001/06/27 19:55 2001/06/27 22:05 02 10
黃色 2001/07/06 12:30 2001/07/07 00:30 12 00
黃色 2001/07/13 01:30 2001/07/13 04:15 02 45
黃色 2001/07/15 14:45 2001/07/15 20:00 05 15
黃色 2001/07/17 13:40 2001/07/17 18:00 04 20
黃色 2001/07/18 06:10 2001/07/18 08:45 02 35
黃色 2001/07/21 03:15 2001/07/21 06:25 03 10
黃色 2001/08/01 15:30 2001/08/01 17:00 01 30
黃色 2001/08/02 18:45 2001/08/02 19:45 01 00
紅色 2001/08/02 19:45 2001/08/02 21:45 02 00
黃色 2001/08/12 22:10 2001/08/12 23:45 01 35
黃色 2001/08/27 22:15 2001/08/28 00:05 01 50
黃色 2001/08/30 12:55 2001/08/30 17:20 04 25
黃色 2001/09/01 05:20 2001/09/01 10:00 04 40
黃色 2001/09/01 17:30 2001/09/01 22:05 04 35
紅色 2001/09/01 22:05 2001/09/01 22:45 00 40
黑色 2001/09/01 22:45 2001/09/02 03:15 04 30
黃色 2001/09/03 02:40 2001/09/03 10:15 07 35
紅色 2001/09/03 10:15 2001/09/03 12:15 02 00
黃色 2001/09/03 12:15 2001/09/03 14:40 02 25
黃色 2001/09/05 06:00 2001/09/05 12:00 06 00
黃色 2001/09/07 15:10 2001/09/07 15:45 00 35
紅色 2001/09/07 15:45 2001/09/07 20:30 04 45
黃色 2002/03/23 06:00 2002/03/23 11:30 05 30
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